W 1670 roku specjalna komisja uznała obraz za cudowny. Sława sanktuarium zataczała coraz większe kręgi. W okresie zaborów Matka Boska Rokitniańska dzięki wizerunkowi białego orła na srebrnej sukience stała się symbolem polskości.

Obecnie kościół jest najważniejszym sanktuarium maryjnym diecezji zielonogórsko-gorzowskiej. Kościół Matki Bożej Rokitniańskiej od 2002 roku nosi tytuł bazyliki mniejszej.

W dniu 8 grudnia 2005 r. – w uroczystość Niepokalanego Poczęcia NMP – bp Adam Dyczkowski, ówczesny ordynariusz diecezji zielonogórsko-gorzowskiej, podniósł kościół w Otyniu do rangi Sanktuarium.